六千年后，曾经鼎盛的剑士一脉已经衰落，只靠剑仙朝青秋一力撑着如今的剑士一脉，以对抗三教共十二位圣人，李扶摇身负大仇，在小国小镇说书为生，去剑山，去妖土，去佛土，在报仇之后，这才明白，整个人间都有一个巨大的骗局，为何六千年前剑士一脉会开始衰落，为何这六千年来，以及六千年前的圣人剑仙们都求不得长生？朝青秋为什么假死留在人间？佛土那盏灯笼到底是什么？妖土的那条龙又是不是天外来客？天外到底有什么？这些东西，都随着李扶摇的不断成长，一步步都被揭开。
公元1633年，大明水师最年轻旗总路长风护送东厂督公下南洋缉拿要犯，遭遇海兽舰队袭击，全军覆没。路长风被一神秘组织所救，随之来到大航海时代国际贸易中心-吕宋岛。岛民们在大明奇人宋应醒的引领下，建立世界融合城市“万国”，反抗西班牙殖民者的残酷统治。出于调查目的，路长风加入宋应醒的组织“天工”，与万国的奇人异士一起对抗殖民者和海上入侵势力。种种领先于时代的发明创造在此登场，令人叹为观止……在历史与现实交织纠缠中，路长风终于领悟“天工”的奥秘，也解开自己身世之谜。五星连珠彗星回归之夜，路长风宋应醒们将书写任何史...
第四季《万古仙穹4：银月城篇》接替上季内容，讲述了娲后三魂仅需找到最后一魂便可重生，古海为救小柔，前去银月城阻止大明王神寻到最后一魂。可银月城内却是更加艰险万分，古海将要面对新的挑战。
大乾王朝和太阳神宫大战在即。为了救出被太阳神宫当做女娲魂之碎片带走的小柔，古海决定韬光养晦，积攒人力和财力。此时恰逢大乾王朝神机营统帅李浩然巡查各地，古海得罪李浩然，被贬为斥候，前往恶人谷调查案件。查案途中却得知一个天大的秘密：太阳神宫利用谷内恶人在制作新式武器……
古海在灵池内疗伤，被蛊虫迷惑心志，差点被控制的时候，小柔突然冲出来挡住蛊虫的侵蚀。被蛊虫报复的小柔遭遇到巨大的冲击，体内的能量突然爆发，灵力大散，小柔受了重伤。古海从幻境中醒来，发现受伤昏迷的小柔被蛊虫包围，立刻帮助小柔驱散蛊虫。感到心痛的古海决心一定要救活小柔，他不能再面对第二个为他而死的女人了。然后怜生大师为救POPO体力大失，也无法救助伤重的小柔。情急之下，只有抢蟠桃的办法了。于是四人小分队又面临与九公子大战的情境。结果，奕天阁发动了阻止蟠桃被抢的反攻，邪恶的蟠桃树散发出吸食人血的阴暗魔力，无数修仙者都丧命在去蟠桃的路上。古海一行人发现了蟠桃的机密，决心救助小柔后破坏这个邪恶的地方。在于九公子的大战中，三人接连受重伤，千钧一发之际，POPO爆发出了强大的能力，与九公子最终厮杀。然后在战事焦灼的时候，被小柔灵力吸引来的大明王神和陈太极一直在高处观战，他们也在伺机抢走蟠桃，而且他们想要的，也远远不止蟠桃那么简单…
九幽世界，弃剑山庄三公子沈振衣得上古武学《万藏剑经》，引得江湖武林觊觎。魔宗领袖蓑衣人为夺剑经与其决战，三公子却从此销声匿迹。 一年后，弃剑山庄重开山门，沈振衣竟要收徒亲授《万藏剑经》！江湖群豪为之震动！ 烈阳府女弟子楚火萝，机缘巧合下成为沈振衣徒弟。随着师徒两人连破迷局，危机也在悄然逼近，最终的阴谋浮出水面之时，一切的缘由，都指向了一个名为“斩月飞仙”的古老传说。
女高中生小叶突然被吸入一个只有年轻男孩子的世界。这个世界被黑暗势力所支配，没有光明。在这里，衣服可以召唤武将、天神等，所以穿戴整齐的小叶成为了这个世界里最强的人，肩负起了找回被黑道夺走的光明的重任，从此开始了在黑暗世界的冒险之旅…
仙乐国太子谢怜接连被贬后第三次飞升成仙，却不慎破坏了神官们的金殿，无人供奉的他只能下凡除鬼来换取功德作为补偿。在凡间的历练中，谢怜结识了两位来帮助他的小神官，并认识了诡王花城，四人一同解决了一件件诡谲的事件，并逐渐接触到了看似光鲜亮丽的仙界众神官的黯然往事。
天宝十二年，天魔复生之期将至，妖王獬狱意图利用天魔统领妖族，颠覆人间，使人间成为妖族之地。人间驱魔司召集青年才俊重返长安，为四年之后的天魔现世做准备。在边境，驱魔司众人再度相聚，后续发现战死尸鬼的暴动。这一切的背后似乎都和传说中的白鹿有关，白鹿究竟在何处呢？
天宝十二年，不谙世事的英俊少年孔鸿俊，肩负三项重任离开太行山上的曜金宫，来到歌舞升平、锦绣繁华的长安。孔鸿俊初入大唐驱魔司，顶头上司竟是不久前交过手的龙武军将领李景珑。而他竟然失手将陈氏心灯打碎，心灯进入了李景珑的体内。在那盏灯的光影里，有平康里的灯红酒绿、驱魔司夏日阳光下的梧桐、茫茫塞外的漫天风沙与飞雪、阿泰如清泉般的歌声、莫日根与陆许摘下的清晨树叶、裘永思飞扬的笔锋。
建文等人为了救出七里，决定前往阿夏号，在阿夏号上遇到了女海盗七杀的刁难，艰难险阻之下救下了七里，但七里却因为自身背负的家族命运无法与建文离开，正当建文踟躇之时，燕王登基消息传来，又恰逢海藏珠现世，阿夏号上要召开比武大会；建文为了报仇，便下定决心要获得海藏珠的力量，开始苦练准备起比武大会。此时阴阳师等人复活邪神的阴谋也陆续浮出水面，建文在阿夏号上与阴阳师等人斗智斗勇。另一方面，骑鲸商团铜雀的到来，给七杀带来了新的消息，建文也许便是解开这一系列阴谋的“命定之人”，建文等人的故事又将走向何方呢？
皇帝巡海之际，太子建文亲眼目睹了自己亦师亦友的郑提督突然弑君，反被朝廷诬陷为弑父夺位，慌乱中驾驶了青龙灵船逃回泉州欲返回金陵向燕王叔叔，郑提督接受监国燕王的命令回到泉州对建文进行缉拿，建文太子识破之后从泉州开启了往南的逃亡之旅，建文逃亡途中结交了东瀛忍者七里、蒙古水师统领腾格斯，博物学家佛郎机人哈罗德，四人在冒险途中结下了真挚的友情，准备展以南海蓬莱岛最大海盗破军基地为目标的逃亡查明郑提督弑君的真相之旅；此时朝堂内外各方势力蠢蠢欲动，郑提督又该如何在这样的条件下继续保护对自己误解愈深的建文和查探皇帝魔化事件的真相呢？
