《五星红旗迎风飘扬2》承接“两弹一星”的故事，从1970年4月我国第一颗人造卫星上天写起，着力塑造毛泽东、周恩来、邓小平等老一辈革命家运筹帷幄，在复杂多变和严峻的国际环境中，审时度势，从容应对，始终立于主动地位。为了维护祖国的主权、领土完整和民族尊严，他们进行的坚定而有理有力的斗争，在严重困难面前，他们带领全国人民，迎难而上，以不屈的姿态和昂扬的精神面貌去战胜和克服困难，终于走出了一条中国特色的社会主义道路。
朱元璋（鲍国安饰）垂暮之年，太子朱标体弱多病，为冲喜，将开国元勋徐达的次女徐妙云（俞飞鸿饰）嫁与朱标，不料新婚之夜，太子即逝，太子妃刚成新娘即成新寡。朱元璋四子燕王朱棣（申军谊饰）乃徐妙云的姐夫，文武皆备，朱元璋欲立朱棣为皇储，遭群臣反对，最终立皇孙朱允炆（高虎饰）为皇储。朱棣和朱允炆都暗恋徐妙云。徐妙云只是对朱棣情有独钟。 朱元璋驾崩，朱允炆即位，对二十五位雄踞全国各地当藩王的皇叔厉行削藩。燕王揭竿而起，经三年多“靖难之役”，从北平打到南京，围攻京城，建文帝朱允炆与徐妙云从皇宫的鬼门逃出城外，朱棣荣登皇位，对建文帝数年追杀。徐妙云同时爱恋着朱棣和朱允炆，京城被围前后，与两位同是大明天子的男人阴差阳错地各有“一夜风流”，半个多月后，徐妙云在与建文帝逃难途中，发现自己已有身孕，但因同时与两位天子有染，竟然难以自辩所怀身孕是哪位天子的骨肉。爱与恨、情与仇，在两位天子与一位绝世皇妃之间展开殊死的搏斗。最终，身怀六甲的徐妙云跳入长江，绝命滚滚波涛，无法面对两位深爱着他的大明天子。 建文帝万念俱灰，削发为僧，四处流浪。明成祖朱棣从此在宫中永不立后，从南京迁都北京，营建紫禁城，一生六次亲征漠北，编成《永乐大典》，派遣郑和下西洋，建立了不朽功绩。当朱棣最后一次征北时，在大沙漠中，遇一游方仙僧，两人长久凝视，潸然泪下。朱棣即逝于凯旋的归途中。后人称朱棣为永乐大帝。
号称“天下第一局”的象棋比赛在大梁皇帝和契丹国间展开，不同于普通的象棋，这里的所有棋子都是活生生的人。一场比赛下来，大梁惨败。忠将叶全忠被奸臣冷子京陷害至死，其家人包括他女儿叶冷心（何美钿 饰）被发配从军；而主将岳怀仙（黄文豪 饰）则死里逃生，被民间棋王薛一骠（张卫健 饰）所救。 在一骠和其母亲的悉心照顾下，怀仙顺利康复，而他的危险却仍旧未被解除。怕有后患的冷子京派他的女儿冷艳（樊亦敏 饰）前来追杀怀仙，但冷艳却在得知真相后，开始对怀仙暗生情愫。他们在逃亡的过程中，邂逅了冷心。一群人阴差阳错的得到了秘籍“七杀真经”，众人从秘籍中练就了绝世武功，开始准备反扑……
这是一个爱恨交缠的故事,这是一个杀机重重的故事，这是一个让人扼腕泪落的故事。在老上海的靡靡之音里，两个血性女子展现了她们非同寻常的一生。
夏远远（徐娇 饰）是一名十七岁的高中生，因为患有先天性痛觉是绝症，所以性格非常的孤僻和古怪，不爱交际的她成绩在班上也是吊车尾的水平，只有同样融入不到集体中去的二次元男孩罗涛（鲁诺 饰）稍微和她走的近一点。 班上来了一位新的班主任名叫李米（蔡卓妍 饰），她似乎有着和前任大相径庭的教育理念。在李米的坚持之下，夏远远和名为顾明耀（胡夏 饰）的男生成为了同桌，顾明耀品学兼优，是班上无数人眼中的天之骄子，这两个八竿子打不到一起的人走到一起后，会发生那些有趣的故事呢？
千年前，孙小天（谢苗 饰）在创造了救世奇迹后却遭九通猿猴冒名顶替，遭受重重打击，失去神力，凭借凡人之身，在谛听（易正福 饰）、万宗山庄少庄主东方陌（林禹 饰）和九天圣姬桑槐（金雅娜 饰）的帮助下，拯救苍生，过程中意外与妖界至尊万妖窟公主玉冰心（南笙 饰）相识、相爱……历经千险集齐三大神器，打败四大魔王，力战九通猕猴，过五关斩六将，最终收获大爱与“真我”。
余真心是一款秘密研发的，专门服务于大龄剩女的恋爱型机器人，实习医生林梦楠阴差阳错间成为了这个产品的首位内测用户。余真心的热情追逐和悉心照料让林梦楠逐渐感到了快乐和依赖。林梦楠重逢以前的学长韩逸枫，余真心主动撮合，但也心生嫉妒。看着林梦楠和韩逸枫越走越近，余真心终于明白人 工智能是不可能替代人类情感的，同时领悟到爱是理智，爱是放手。他开始有意训练林梦楠的生活、工作和学习能力。当林梦楠考完医师资格证出来时，他已彻底报废，静静的躺在了实验室里......
宋紫，一个俏皮可爱的喵女孩，陆吾，一个外冷内热的帅气男孩，他们因为猫咪而经历了一场不打不相识的相遇。二人力求在喵星人和人类之间寻找一个相爱的支点，整个过程充满了人类与爱宠之间的治愈，令人暖意倍生，同时二人的日常相处也趣味横生，笑点不断。
晚清时代，初秋时节，徽州富商程府的二爷从杭州专程赶回来为程家老太太庆祝六十大寿，程府二奶奶祝绍兰在一别三年之后再次见到丈夫，兴奋得意之情溢于言表，而离家五年的程府大爷程嘉和，因临时被皇上召进宫，并未如约归来，程府掌事大奶奶杜兰馨黯然神伤……
出身贫苦的马天明遭陷害卷入一桩灭门惨案，逃亡过程中意外顶替了留洋医生蔡里昆的身份藏身于衡山医院。 红色商人朱天德手里掌握着一大笔秘密的红色资金，却在躲避敌人追捕时突发急病昏迷不醒，住进了衡山医院。中统、力行社的特务，日本军部，上海青帮等各方势力都对这笔巨款虎视眈眈。 因枪击重伤也住进了衡山医院的蔡里昆本人，正是苏区派来接应朱天德的特派员，他让马天明继续维持假身份，二人结盟与各方恶势力周旋。 在险象环生的斗智斗勇中，原本一心为财的马天明被革命者蔡里昆的高风亮节所打动，真正成长为一个深晓民族大义的共产党人，最终战胜了恶徒，完成了组织交予的任务，同时也为自己洗清了冤屈。
白牡丹（朱近桐 饰）不受感情的左右，决心要找出父亲的死因。随着白牡丹与阎良（朱旻昕 饰）多番博弈，两人决定联手寻找真相，他们之间的感情慢慢摩擦升温。但由于程峰（胡博文 饰）的插足，阎良与白牡丹之间不断产生误会。“杀父仇人”与“爱人”之间的角色的迥异，让白牡丹不得不面临艰难抉择的抉择。在此国仇家恨面前选择了为民族大义，联手共抗敌人。
韦中正（尤勇饰）是一个非常成功的男人，他不仅拥有一家实力雄厚的大公司，而且有一个幸福美满的家庭。在一次舞会上，他邂逅了酷似他的初恋情人的女记者梦璐（余小雪饰），从此，他逐渐偏离了感情的航道。而这一切，都被韦妻吴亚宁（娟子饰）察觉了。吴亚宁的弟弟、医生吴晓冬在一次诊疗中结识梦璐后，立即痴情地爱上了她。但在某一天，吴晓冬却出人意料地在梦璐家里丧了命……
解放初期，国民党撒离大陆之前，不甘失败，留下部分部队、军火和特务潜伏在乌龙山地区，联合当地土匪为反攻大陆做准备，国民党特务长老猫（袁苑饰）在台湾操控着整个局面。他们发动了声势浩大的暴动，烧杀抢掠，一时间人心惶惶，时局巨变。某解放区区长王群（郭广平饰）和副区长徐翠（孙岚饰）妇女主任苏凤娇（李婷饰）率领民兵浴血奋战，终于打退了敌人的几次暴动。 王群、徐翠成了敌人的眼中钉，频频逼遇伏击，王群的通讯员小黄突然牺牲，几个重要罪犯突然死亡，所有线索告诉王群，他的身边有一个看不见的人物在给敌人提供着重要的情报和策划着一次又一次的伏击战。他发动群众进行了大围剿，但国民党的余孽和土匪首领并没有得到彻底的肃清，为了迅速抓获敌首，他冒险进入了匪窝，成功离间了土匪头目李雄（张琪饰）与国民党司令林崇美（李宏伟饰）之间的同盟。当胜利在望时，一个出人意料的情况出现了，他终于发现了一直在努力寻找的那个神秘人物竟然是他深爱的苏凤娇！两个相爱的人拔枪相对……
