惨烈的八年抗战结束，随之而来的是国共两党阋墙之争。国民党逃亡台湾岛，也让许多戎马在外的游子远离了家乡和父母，遥望故乡，惟有泪千行。路根生（张国立 饰）便是这百万退到海岛的老兵中的一员，他们匆匆离开，没有等到“反攻大陆”的时刻，反而在陌生的土地被迫扎根。许多年来根生在江西的结发妻茶嫂（奚美娟 饰）都不知丈夫的死活，他有心回家，但高压的政治环境让他和伙伴们动弹不得。曾经血气方刚的老兵陆长功（陈宝国 饰）如今是警总官员，却反过来监视老兵的一举一动，防止他们有任何企图叛逃匪区的僭越之举。所谓的“荣民”，没有一丝光荣可言，心中的酸楚只有自家清楚。
　　娘盼儿归，浅浅的海峡怎么就阻隔了数十年的回家之路啊……

　　民国四年秋，在袁世凯庇护下的末代皇帝溥仪的皇宫下旨，要景德镇烧制祭红大龙缸祭天。官窑主赵孚生多次烧制而失败。按朝廷制度，赵孚生理当处死。经不住赵孚生再三求饶，督陶官鲁公公同意按他的要求采用旧俗童女祭窑再烧一次。
　　景德镇最大的民窑主陶盛仁为人耿直，并富有正义感。因他的儿子陶昌南跟赵如意从小就订下了娃娃亲，他找鲁公公和卫县长，希望他们不要拿人的性命祭窑，他愿意立下军令状，烧制大龙缸。鲁公公和卫县长巴不得有个替死鬼，当即答应。
　　陶盛仁深知此事重大，风险太大，万一失败，自己肯定会被处死，便要小喜子出发，把在南昌念书的儿子陶昌南叫回来。
　　陶昌南在回景德镇的船上，碰到了从法国留学回来的卫县长的女儿卫秋禾。卫秋禾因想救一只落在船头受伤的小鸟落水，陶昌南同时救起了她和那只小鸟。两人一见钟情。
　　陶盛仁烧出的大龙缸，同样质量不合格。陶盛仁服毒自杀。临死前，为了保住家族，他要陶昌南弃学，接管陶家瓷业，并守约娶赵孚生女儿赵如意为妻。
　　赵孚生见陶家落败，便有意悔婚，陶昌南赌气之下，主动提出解除婚约。他一直对家庭包办的婚姻十分不满。当然，更主要的原因是他喜欢上了卫秋禾。
　　赵如意对卫秋禾跟陶昌南经常在一起，内心充满妒忌，她通过景德镇的英国神父华莱士，找到了青羊山的土匪刘猛子，在县城劫走了卫秋禾。
　　陶昌南四处寻找卫秋禾的下落，无意中见山里大火烧毁民房，他奋不顾身地将刘猛子母亲救了出来。刘母随陶昌南上山，刘猛子是个孝子，在母亲的劝说下放出了卫秋禾。
　　陶昌南的事业日益红火，开始着手开拓江苏，安徽，广东，上海等商埠。赵孚生的儿子赵如鑫因痛恨陶昌南悔婚，便以官窑雄厚的实力，联手华莱士，在上海，湖北，九江等地故意降低价格竞争客户，把陶昌南逼上了绝路。
　　陶昌南的货物积压严重，资金一时无法周转，造成窑工的工资都发不出。为了保住窑厂，他偷偷把一尊祖传的祭红达摩瓷佛像，抵押给了景德镇另一个民窑主张之望。
　　陶昌南明白，要想在跟赵家的竞争中保持不败，只有研究出自己独有的产品。他和卫秋禾配合，从古方中研究出一种从元代就失传的釉里红瓷器。陶昌南取名为美人醉，产品大受欢迎。卫秋禾帮他把产品拍成照片，在南昌召开新闻发布会，向全国推介陶家窑场的产品，打破了赵如鑫在景德镇一手遮天的梦想。
　　日本商人和田来到景德镇，利用手下良秀子的姿色，引诱赵如鑫，荻得了赵家青花配方，并在景德镇开了一家大烟馆。
　　景德镇天灾，大水淹没了昌江两岸，房屋冲垮，农田减产，瘟疫流行。赵如鑫趁机收购米粮，在景德镇卖高价。陶昌南对他的行为十分不耻，将陶家资产拿出来跟他对着干；景德镇有名的画家群体珠山八友也举办画展赈灾义卖，买粮食盖草房免费救助百姓。赵如鑫发财梦破灭，内心对陶昌南痛恨至极。
　　卫秋禾在救治瘟疫中的百姓时，不幸自己染上了重疾，差点死去，幸亏她的法国同学麦克伦得知消息，从法国送来了特效药，才使她起死回生。
　　这一年，陶昌南跟卫秋禾结婚。赵如意嫁无奈嫁给了景德镇另一个民窑主张之望的儿子张仁和。
　　在上海的东北商人王德明做生意失败，即将破产，陶昌南在关健时刻帮助了他，让他很感动。为了报恩，王德明希望把女儿王雪玉嫁给他，陶昌南表示家有贤妻，不可再娶。当天晚上，王德明把陶昌南灌醉了，将王雪玉送到他身边。陶昌南跟王雪玉成其好事。事后，陶昌南非常自责，再三跟王雪玉道歉。
　　这年冬天，王雪玉来到景德镇，她怀孕了来找陶昌南。她知道陶昌南不可能娶她，但她想见陶昌南最后一面，并要陶昌南给即将出生的婴儿取名。此事引起了卫秋禾的妒忌。她向陶昌南表示，她不是旧式女人，如果陶昌南要把王雪玉接回家，她就跟他离婚。
　　不久，王雪玉生下一个儿子，陶昌南取名思北。王雪玉不想让陶昌南为难，带着思北回了上海。
　　陶昌南为了把事业做大，不但在上海、南昌、九江等地开分号，还想把瓷器远销欧美，打开海上瓷路。他亲自率船队从马六甲海峡到法国，不幸的是遭到海盗袭击，遭受惨重损失。
　　赵如鑫想趁机将陶昌南打垮，勾结省城驻军军阀白师长把陶昌南抓进牢里。理由是当年陶昌南资助过红军。
　　陶夫人得知陶昌南即将被处死时，悲怆去世。
　　白师长老奸巨猾，想借南昌国民政府之手杀陶昌南。当他将陶昌南带出景德镇时，早已参加红军的陶昌南三弟陶昌洋带人打伏击，将白师长的部队打了个落花流水，把陶昌南救了出来。
　　抗战爆发，陶昌南担心上海王雪玉和儿子陶思北的安危，准备将他们接回景德镇。当他到上海时，王雪玉已出家。正当陶昌南一行逃出上海时，被和田手下发现。王德明为了保护陶昌南和陶思北，被愤怒至极的和田乱枪打死。
　　为了支援抗战，陶昌南筹备了一批抗战物资，赵如鑫得知消息后，通知和田，和田派出良秀子和两个浪人，准备在陶昌南运输抗战物质时，将船炸沉。赵如意因一直不能忘情陶昌南，偷偷给陶昌南报信。陶昌南在船上一举抓获那两个浪人，良秀子跳水逃跑。
　　赵孚生知道儿子跟日本人勾结后，将赵如鑫赶出了景德镇。
　　抗战胜利，陶昌南和卫秋禾到尼姑奄看望王雪玉，希望她能跟他们回景德镇一起生活。王雪玉看破红尘，不肯离开尼姑奄，但她要陶昌南将思北带走，好好养大，学有所成。
　　潜伏在南昌的良秀子为了完成和田的任务，拿到陶家祖传佛像，和赵如鑫偷偷跑回景德镇。在盗窃陶家佛像时，被陶昌南发现。赵如鑫朝陶昌南开枪，无意中将跑上前来阻止的赵如意打死了。看着自己最疼爱的妹妹躺在地上，赵如鑫绝望地开枪自杀。
　　麦克伦夫妇来景德镇，看望卫秋禾。陶昌南和卫秋禾委托他将陶思北带到法国留学，将来学成后好报效祖国……

　　1840年第一次鸦片战争后，清王朝陷入了内忧外患的境地，西方列强不断进行侵略和恫吓，1856年英法两国又发动了第二次鸦片战争，清王朝更是国力日衰。面对列强的威胁，朝廷中以恭亲王奕訢为首的改革派提出开展洋务运动，走富国强兵之路。
　　1866年，以左宗棠、沈葆桢为代表的改革派和以慈禧太后、倭仁为代表的保守派进行了反复、激烈的斗争，他们顶住了来自各方的压力，克服了种种困难，终于在福州马尾建造了造船厂，开设了船政学堂，造出我国第一艘具有当年先进水平轮船，培养出我国第一代海军。
　　32集电视剧《船政风云》真实地再现了这一阶段的历史，讴歌了左宗棠、沈葆桢等一批爱国者的历史功绩，突出表现了人民群众是创造历史的动力这一主题，以及人民群众的爱国主义精神和人民群众在历史发展进程中的历史地位和作用。
　　1866年春左宗棠就在福州设厂造船一事给朝廷上书，慈禧太后在恭亲王奕訢的力劝下同意左宗棠在福州设厂造船。8月，左宗棠亲至福州，购买民田200多亩做为厂基，又聘请法国人日意格，德克碑为正、副监督。正当筹备工作紧张进行时，清政府调左宗棠任陕甘总督，去西安镇压捻军起义。突然的变化使处于初创阶段的船政局工程面临夭折的危险，左宗棠表示决不半途而废，他向清廷保举原江西巡抚沈葆桢出任“总理船政大臣”。沈葆桢上任后积极筹备造船厂，设立船政学堂，以培养自己的造船工程师和海军军官；设置船政衙门，总理船政事务。面对来自至上而下守旧势力的干扰、破坏，英桂、沈葆桢等船政官员团结一致，共同奋斗，克服了一个又一个的困难。为了惩治以闽浙总督吴棠、布政使邓延楠等反对船政的贪官，沈葆桢果断处决了吴、邓的下属苏利和李有才，达到了以儆效尤的效果。洋监工日意格带领十几位专家和技工到来，马尾船厂正式开工造船。1869年第一艘具有先进水平的兵商两用轮船——万年清号成功下水，实现了船政大业。
　　沈葆桢拒绝了法国人驾驶轮船出海试航的要挟，亲自带领船政学堂培养的第一批中国未来的海军军官，登上“万年清”随船试航。并委托吴大廷随船北上天津卫接受朝廷检阅。
　　由于船政超支较多，沈葆桢奏请朝廷追加拨款，朝廷批准。沈顶住保守派压力，扩大造船厂，增加学堂，在合同期内共造各种兵船、商船15艘，为中国之最。
　　1874年5月，日本中将西乡从道下令路军少将谷干城、海军少将赤松则良率兵在台湾南端登陆。以强大的火力逼迫当地牡丹社投降，被打得狼狈后撤。由于汉奸的出卖，阿禄酋长不幸中弹牺牲。当地百姓化整为零，藏在密林中打击倭寇。1874年6月沈葆桢率领船政学堂的毕业生出兵台湾。沈到台后，确定了“驱倭抚番”的大计。他为安平炮台题写了“亿载金城”四个大字。就在沈葆桢一切部署完毕，等待向日寇发起致命一击时，收到了中日签订的《北京条约》，沈等官员悲痛万分。倭寇从台湾撤退后，沈葆桢制定了“开山抚番”的方针，开山修路，移风易俗，建设台湾、保卫台湾，逐渐实现了各民族的大融合。
　　为了学习西方各国的造船技术和驾船经验，朝廷批准船政学堂毕业生分别赴英、法等国学习。严崇光、刘步蟾等学成回国后都成为清政府海军骨干。
　　1884年7月法国远东舰队司令孤拔率领舰船闯入福建马尾港，利士比亲率四艘法舰驶往基隆，发起攻击。清政府急召刘铭传受命，加以巡抚全权督办台湾事务。刘铭传欣然受命，渡海抵达台湾，筹谋抗击法军，取得重大胜利。朝廷给于他们奖励。借口“基隆事件” 法国政府向清政府下达了最后通牒。8月23日下午法舰向中国军舰发动袭击，士兵临危不惧奋勇还击。由于李鸿章妥协退让，不许“轻言战事”，福建船政大臣何如璋不做戒备，还禁止军舰移动，使福建水师损失惨重。慈禧太后对马江之战11艘兵船损失和上千人伤亡的惨状伤感不已。面对法国人的嚣张气焰毅然决定对法宣战。授以左宗棠为钦差大臣，督办福建军务。孤拔命令利士比率八艘战舰向基隆发起猛攻，刘铭传作出“撤基援沪”决策，取得了有名的“沪尾大捷”。左宗棠率五千人马进入福建。他用明修栈道，暗渡陈仓的偷渡计，使援军安全抵台，在刘铭传指挥下粉碎了法国远东舰队侵台的梦想。孤拔亲率法远东舰队从基隆撤退后占领澎湖群岛身染赤痢去世。
　　左宗棠表示，为了让子孙后代永远不忘船政魂魄，一定要建造马江昭忠寺，将所有将士的英名刻碑留存。但当他看到屈辱的《中法会订越南条约》，气得顿时口吐鲜血，病逝福州。严复、詹天佑、邓世昌等船政学堂的毕业生及众乡亲为纪念马江之战建成昭忠祠，他们向烈士墓行大礼，祭奠烈士英魂。