三桥晴子的看护对象高泽喜十郎,被寺田卓送去成为由第6世代电脑控制的高性能看护床“Z-001”实验对象。为了救出喜十郎,晴子在骇客老人的帮助下利用喜十郎亡妻高泽春的声音来唤醒喜十郎,电脑却因此产生春的人格而开始失控。
地球所存在的海姆冥界森林威胁解除过后,从过去争斗的漩涡中获得黄金果实而成为“起始之男”的葛叶纮汰 / 假面骑士铠武,与“起始之女”高司舞在遥远的新生星球中共同生活。某天,谜之机械生命体却突然来袭及将舞拐走,以强横的实力令铠武陷入劣势并读取其的记忆,从中得知地球的存在后利用空间转移开始展开侵略。